有机肥主要起到以下几个方面的作用。

1、提供作物生长所需的养分

有机肥料富含作物生长所需养分，能源源不断地供给作物生长。除矿质养分以外，有机质在土壤中分解产生二氧化碳，可作为作物光合作用的原料，有利于作物产量提高。同化肥相比，有机肥料在养分供应方面有以下显著特点。

（1）养分全面   不仅含生长必需16种营养元素，还含有益于作物生长的元素，全面促进作物生长。

（2）养分释放均匀长久  有机肥料所含的养分多以有机态形式存在，通过微生物分解转变成为植物可可利用的形态，可缓慢释放，长久供应作物养分。

（3）养分含量低    纯有机肥料所含的养分比较低

 2、改良土壤结构，增强土壤肥力

（1）提高土壤有机质含量，更新土壤腐殖质组成，增肥土壤。

土壤有机质是土壤肥力的重要指标，是形成良好土壤环境的物质基础。腐殖质是土壤中稳定的有机质，对土壤肥力有重要影响。

（2）改善土壤物理性状。

有机肥料在腐解过程中产产生羟基一类的配位体，与土壤黏粒表面或氢氧聚合物表面的多价金属离子相结合，形成团聚体，加上有机肥料的密度一般比土壤小，施入土壤的有机肥料能降低土壤的容重，改善土壤通气状况，减少土壤栽插阻力，使耕性变好。比热容较大，导热性小，颜色又深，较易吸热，调温性好。

（3）增加土壤保肥、保水能力。

有机肥料在土壤溶液中离解出氢离子，具有很强的阳离子交换能力，施用有机肥料可增强土壤的保肥性能。土壤矿物颗粒的吸水量最高为50％～ 60％，可增加土壤持水量，一般可提高10倍左右。

3、提高土壤的生物活性，刺激作物生长

微生物在活动中或死亡后所排出的东西，不只是养分，不只是N、P、K等无机养分，还能产生谷酰氨酸、脯氨酸等多种氨基酸，多种维生素，还有细胞分裂素、植物生长素、赤霉素等植物激素。少量的维生素与植物激素，就可给作物的生长发育带来巨大影响。

4、提高解毒效果，净化土壤环境

例如：增施鸡粪或羊粪等有机肥料后，土壤中有毒物质对作物的毒害可大大减轻或消失。有机肥料的解毒原因在于有机肥料能提高土壤阳子代换量，增加对镉的吸附。同时，有机质分解的中间产物与镉发生螯合作用形成稳定性络合物而解毒，有毒的可溶性络合物可随水下渗或排出农田，提高了土壤自净能力。